How to detect coronavirus
Moleculaire diagnostiek biedt een snelle en efficiënte methode om onderscheid te maken tussen pathogenen en onschadelijke micro-organismen en helpt het nieuwe coronavirus op te sporen. Met de verspreiding van nieuwe, levensbedreigende infecties, kan de hele wereld tegenwoordig van slag raken. De kritieke punten voor de verspreiding van epidemieën worden grotendeels beheerst door ons wereldwijde netwerk. Pas onlangs is vastgesteld dat gevaarlijke pathogenen zoals norovirussen, coronavirussen en EHEC-bacteriën, epidemieën en pandemieën veroorzaken.
Hoe worden norovirussen of coronavirussen gedetecteerd?
Met moleculaire diagnostiek worden verborgen ziektekiemen zichtbaar. De snelste en meest efficiënte methode die tegenwoordig wordt gebruikt voor de detectie van pathogenen zoals het coronavirus is kwantitatieve Real Time (RT) PCR. De qPCR is een verdere ontwikkeling van de klassieke PCR-methode (polymerase kettingreactie).
Delen van specifieke nucleïnezuursequenties, DNA of RNA, van organismen kunnen specifiek worden gedetecteerd met behulp van startfragmenten, zogenaamde oligonucleotiden of primers. De techniek is gebaseerd op exponentiële amplificatie van doel-DNA met behulp van de thermostabiele Thermus aquaticus (Taq) polymerase of andere hittebestendige enzymen. Het DNA of RNA wordt aanvankelijk geïsoleerd uit het monstermateriaal. Als RNA-virussen, b.v. als norovirussen of coronavirussen in het monstermateriaal moeten worden gevonden, wordt het RNA in DNA-moleculen getranscribeerd door een enzymatische voorbehandeling, een zogenaamde “omgekeerde transcriptie”.
Voor de daaropvolgende real-time PCR, fluorescerende kleurstofmoleculen zoals b.v. B. SYBR-Green opgeslagen in het DNA in het nieuw gesynthetiseerde dubbelstrengs DNA. Door deze fluorescerende moleculen te gebruiken, kan de amplificatiereactie in real time worden gevolgd en gekwantificeerd. Door de exponentiële toename van het uitgangs-DNA (template) neemt het aantal fluorescentiesignalen toe met het toenemende aantal PCR-producten. Het fluorescentiesignaal is evenredig met de hoeveelheid versterking. Meer informatie….
